Het boek geeft een systematisch overzicht van de belangrijkste esoterische thema's. Alle spirituele sleutelbegrippen, zoals het etherische en het astrale lichaam, reïncarnatie en karma, worden stap voor stap toegelicht. Steiner beschrijft in uitvoerige hoofdstukken de werkelijkheid van de slaap en van de dood, het geestelijk verleden van mens en aarde, de weg van de inwijding en het heden en de toekomst van de menselijke ontwikkeling. Door de veelomvattende inhoud en vooral ook door de inzichtelijke opbouw is De wetenschap van de geheimen der ziel hét basiswerk van Steiners spirituele wetenschap, de antroposofie