In Clans probeert elke speler de overwinning te behalen door zoveel mogelijk punten te scoren voor zijn of haar kleur. Dit is lastig, omdat de kleur van elke speler willekeurig wordt gekozen en tot het einde van het spel geheim blijft. Elk van de 12 regio's op het speelbord bestaat uit vijf gebieden, elk met een van de vier verschillende terreintypes. Elk gebied krijgt één hut van elk van de vijf verschillende kleuren. Tijdens hun beurt verplaatst een speler alle hutten van een gebied met minder dan zeven hutten naar een aangrenzend bezet gebied, terwijl hij of zij probeert te verbergen welke kleur van de speler is. Als na het verplaatsen een of meer gebieden volledig omringd zijn door lege gebieden, worden deze gebieden gescoord. Als alle kleuren aanwezig zijn in een scoregebied, worden alle kleuren met slechts één hut verwijderd. De epoch-track laat een beperkt aantal gebieden punten scoren voordat het spel eindigt. Elke score kan een bonus opleveren of geen punten, afhankelijk van het terreintype en hoe ver het spel op de track is gevorderd. Elke score brengt de track verder, en elk deel van de track geeft bonussen en straffen voor verschillende terreintypes.
Zodra minstens twaalf gebieden punten hebben gescoord, eindigt het spel. Daarna onthullen de spelers hun kleuren om te zien wie de meeste punten heeft behaald zonder zijn of haar kleur te verliezen. Voor 2-4 spelers