In contra-commando wordt het team geconfronteerd met de chaos in het rusland van nu. Tegengewerkt door criminele en reactionaire machtsblokken - de meedogenloze mafia, de ultrarechtse nationalisten en de neo-tsaristen - tracht de russische president een nieuwe democratische orde op te bouwen. Ter bestrijding van deze machtige krachten wordt het op-center-team ingezet. Een zware taak, temeer daar al snel blijkt dat deze zelfde krachten over een goed georganiseerde, nietsontziende contra-organisatie beschikken...