In X-MEN FIRST CLASS zien we hoe grote gebeurtenissen in de wereld het begin inluiden van de epische X-Men saga. De film vertelt het verhaal over het ontstaan van de hechte vriendschap tussen Charles Xavier en Erik Lensherr, beter bekend als Professor X en Magneto, die voor het eerst hun krachten ontdekken. Samen met andere mutanten proberen zij de wereld te redden van Armageddon. Maar als er een kloof ontstaat tussen de twee vrienden, mondt die uit in de eeuwigdurende oorlog tussen de Brotherhood van Magneto en de X-Men van Professor X.